Második forduló

A második forduló párosítása
jelzés	párosítás	első mérk.	visszavágó
A	Akratitosz (görög)-Allianssi (finn)	0-1	0-0
B	Örgryte IS (svéd)-O. Nice (francia)	3-2	1-2
C	1. FC Synot (cseh)-OFK Beograd (szerb-montenegrói)	1-0	3-3
D	Racing Santander (spanyol)-Győri ETO (magyar)	1-0	1-2
E	FC Slovan Liberec (cseh)-Shamrock Rovers (ír)	2-0	2-0
F	FC Thun (svájci)-1. FC Brno (cseh)	2-3	1-1
G	Brescia (olasz)-Gloria Bistrita (román)	2-1	1-1
H	Marek Dupnica (bolgár)-VfL Wolfsburg (német)	1-1	0-2
I	Sahtyor Szoligorszk (fehérorosz)-NK Cibalia (horvát)	1-1	2-4
J	St.-Truidense (belga)-Tobol Kosztanaj (kazah)	0-2	0-1
K	Willem II (holland)-FC Wil (svájci)	2-1	1-3
L	FK Pobeda (macedón)-SV Pasching (osztrák)	1-1	1-2
M	Szloboda Tuzla (bosnyák)-Lierse SK (belga)	1-0	1-3
N	Tampere United (finn)-FK Szutyeszka (szerb-montenegrói)	0-0	1-0
O	Dacia Chisinau (moldáv)-Partizani Tirana (albán)	2-0	3-0
P	NK Koper (szlovén)-FK Dubnica (szlovák)	1-0	2-3
A második forduló párosítása
jelzés	párosítás	első mérk.	visszavágó
A	Akratitosz (görög)-Allianssi (finn)	0-1	0-0
B	Örgryte IS (svéd)-O. Nice (francia)	3-2	1-2
C	1. FC Synot (cseh)-OFK Beograd (szerb-montenegrói)	1-0	3-3
D	Racing Santander (spanyol)-Győri ETO (magyar)	1-0	1-2
E	FC Slovan Liberec (cseh)-Shamrock Rovers (ír)	2-0	2-0
F	FC Thun (svájci)-1. FC Brno (cseh)	2-3	1-1
G	Brescia (olasz)-Gloria Bistrita (román)	2-1	1-1
H	Marek Dupnica (bolgár)-VfL Wolfsburg (német)	1-1	0-2
I	Sahtyor Szoligorszk (fehérorosz)-NK Cibalia (horvát)	1-1	2-4
J	St.-Truidense (belga)-Tobol Kosztanaj (kazah)	0-2	0-1
K	Willem II (holland)-FC Wil (svájci)	2-1	1-3
L	FK Pobeda (macedón)-SV Pasching (osztrák)	1-1	1-2
M	Szloboda Tuzla (bosnyák)-Lierse SK (belga)	1-0	1-3
N	Tampere United (finn)-FK Szutyeszka (szerb-montenegrói)	0-0	1-0
O	Dacia Chisinau (moldáv)-Partizani Tirana (albán)	2-0	3-0
P	NK Koper (szlovén)-FK Dubnica (szlovák)	1-0	2-3

Az első mérkőzéseket minden esetben az elöl álló csapat otthonában játszották.